Вообще это прошение о искоренении расколов и разделений в Церкви.
Есть и другое объяснение, более расширенное - "О мире всего мира, о благосостоянии святых Божиих церквей и соединении всех Господу помолимся; этими словами мы просим Бога, чтобы Он послал нам согласие, дружбу между собою, чтобы мы удалялись ссор и вражды, которые противны Богу, чтобы никто не обижал церквей Божиих, и чтобы все неправославные христиане, отделившиеся от православной Церкви, соединились с нею."
http://www.orthedu.ru/books/sluzhen/s_2_1.htm
